MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanocaldococcus sp. FS406-22 chromosome

Total Repeats: 6385

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013887	A	6	6	5	10	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013887	CCT	2	6	723	728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013887	AATTT	2	10	750	759	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013887	AAC	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013887	AG	3	6	2935	2940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013887	TTTC	2	8	4707	4714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013887	TGA	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013887	AATT	2	8	6156	6163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013887	ATTTT	2	10	6216	6225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013887	ACATT	2	10	7132	7141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013887	ATA	2	6	7148	7153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013887	AT	3	6	7158	7163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013887	A	6	6	9192	9197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013887	A	6	6	9235	9240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013887	TAT	2	6	9280	9285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013887	ACT	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013887	ATTT	2	8	9316	9323	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013887	TTA	2	6	9325	9330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013887	ATATTA	2	12	9335	9346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013887	AAC	2	6	9350	9355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013887	CCT	2	6	10634	10639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013887	T	6	6	10662	10667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013887	ACC	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_013887	T	6	6	10677	10682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013887	TTG	2	6	10724	10729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013887	TAT	2	6	10747	10752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013887	AT	3	6	10765	10770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013887	TGT	2	6	10795	10800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013887	GAG	2	6	10861	10866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013887	TCA	2	6	10946	10951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013887	TAAA	2	8	10989	10996	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013887	T	6	6	11000	11005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013887	ATG	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013887	CTAT	2	8	11069	11076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013887	AT	3	6	11218	11223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013887	ATT	2	6	11229	11234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013887	AAAATA	2	12	11235	11246	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013887	AT	4	8	13406	13413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013887	TAC	2	6	13452	13457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013887	T	6	6	15453	15458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013887	ATT	2	6	15464	15469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013887	ATTTT	2	10	16619	16628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013887	TTATT	2	10	16629	16638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013887	GGT	2	6	16646	16651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013887	T	6	6	16651	16656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013887	TTTAAA	2	12	18072	18083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013887	A	6	6	18081	18086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013887	GAT	2	6	18159	18164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013887	ATT	2	6	18168	18173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013887	TA	3	6	18176	18181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013887	TCAA	2	8	18185	18192	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013887	TCT	2	6	18518	18523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013887	GAA	2	6	18545	18550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013887	ATT	2	6	18553	18558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013887	T	6	6	19956	19961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013887	A	6	6	20047	20052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013887	T	6	6	21302	21307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013887	TA	4	8	22061	22068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013887	GTT	2	6	22090	22095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013887	AT	3	6	22100	22105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013887	AAGT	2	8	22109	22116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013887	TA	5	10	22134	22143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013887	TA	3	6	22175	22180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013887	CCT	2	6	22181	22186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013887	TAG	2	6	22203	22208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013887	AATT	2	8	22236	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013887	TTAA	2	8	23063	23070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013887	TCT	3	9	25595	25603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013887	TTA	2	6	25608	25613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013887	TA	4	8	25643	25650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013887	A	7	7	25650	25656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013887	TA	3	6	25678	25683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013887	ATT	2	6	25699	25704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013887	ATATT	2	10	26218	26227	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013887	T	6	6	26226	26231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013887	ATTA	2	8	26235	26242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013887	TA	4	8	26274	26281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013887	TAT	2	6	26293	26298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013887	CTA	2	6	26324	26329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013887	GTGAG	2	10	26339	26348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013887	TC	3	6	27262	27267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_013887	TTA	2	6	27268	27273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013887	ATA	2	6	27274	27279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013887	TAT	2	6	29570	29575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013887	T	6	6	31006	31011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013887	TA	3	6	31014	31019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013887	TTTA	2	8	31022	31029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013887	ATAAA	2	10	31398	31407	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013887	ATG	2	6	31417	31422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013887	TTTA	2	8	32187	32194	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013887	TCTTT	2	10	32208	32217	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013887	TA	3	6	32271	32276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013887	TTA	3	9	32277	32285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013887	TAACT	2	10	32293	32302	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013887	AGG	2	6	32312	32317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013887	CCACA	2	10	38729	38738	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_013887	A	6	6	38738	38743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013887	TTAT	2	8	39644	39651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013887	TTA	2	6	39666	39671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013887	TTAAA	2	10	39678	39687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013887	GTT	2	6	39706	39711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013887	TAA	3	9	39715	39723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013887	A	6	6	39722	39727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013887	GA	3	6	39751	39756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013887	AGA	2	6	41392	41397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013887	A	6	6	41464	41469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013887	TAT	2	6	41500	41505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013887	TACC	2	8	41511	41518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013887	AAT	2	6	41552	41557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013887	TAT	2	6	41580	41585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013887	AAAG	2	8	41759	41766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013887	A	7	7	41891	41897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013887	TAA	2	6	42037	42042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013887	AAAG	2	8	42053	42060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013887	ATA	2	6	42110	42115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013887	TA	3	6	42114	42119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013887	TAT	2	6	42186	42191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013887	ATTG	2	8	42197	42204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013887	ATT	2	6	42223	42228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013887	AGAAT	2	10	42264	42273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013887	AGA	2	6	42295	42300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013887	AAT	2	6	42310	42315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013887	ATAA	2	8	42320	42327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013887	AAAC	2	8	42368	42375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013887	AC	3	6	42374	42379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013887	CTA	2	6	42396	42401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013887	T	6	6	42413	42418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013887	TGT	2	6	42442	42447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013887	AATAAA	2	12	42459	42470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013887	A	7	7	42468	42474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013887	ATA	2	6	42547	42552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013887	ATT	2	6	42590	42595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013887	TGA	3	9	42629	42637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013887	ATA	2	6	42682	42687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013887	AT	3	6	42692	42697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013887	A	6	6	42717	42722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013887	TAA	2	6	42733	42738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013887	A	6	6	42760	42765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013887	TTATTT	2	12	42766	42777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013887	T	6	6	42775	42780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013887	T	7	7	42822	42828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013887	AT	3	6	42911	42916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013887	T	6	6	42945	42950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013887	GAT	2	6	42966	42971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013887	AAT	2	6	43007	43012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013887	TTA	2	6	43023	43028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013887	AGA	2	6	43053	43058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013887	AGAA	2	8	43061	43068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013887	TA	4	8	43870	43877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013887	TTA	2	6	44759	44764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013887	T	6	6	44766	44771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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